当需要对安全柜的任何被污染的部分进行日常维护、更换过滤器，以及性能测试等工作时，必须进行消毒处理。认证试验和气体消毒进行前，所有内部工作面和暴露的外表面都应用适当的消毒剂进行消毒。此外进行认证试验前，用生物安全级别 2 级指定的药剂，以气态形式对整个安全柜消毒合乎要求。当安全柜已使用过，推荐用生物安全级别 3 级指定的试剂消毒。有被生物因子污染潜在危险的安全柜移动位置时应先消毒。

另外，实验用试剂溢出和溅出后，被污染的表面应进行适当的消毒。

大部分需要气体消毒的情况下，后面所述的程序使用解聚的多聚甲醛作消毒剂。用其他替代方法消毒前，必须给出每一型号和尺寸的安全柜的周期参数和这些参数的有效性；材料的相容性关系到备选去污剂的退化和被吸收情况，是维护安全柜完整性和消毒所需时间的关键因素。某些情况需要这些替代方法，例如：减缓疾病病毒。消毒方法由使用者和认证机构磋商确定。

当用多聚甲醛进行气体消毒时，指出规定的面积、选择的防毒面罩、保护设施、相应的测试、医学监视、危害传达和训练、记录保管等并按下列步骤进行：

a、将高、宽、深相乘，计算出安全柜的总体积；

b、安全柜总体积乘以11g／m3，确定所需多聚甲醛的质量。按化学计量确定碳酸氢铵或其替代品的量，提供氨气与甲醛进行中和反应。碳酸氢铵多称出 10%的质量，保证反应完全；

c、如果安全柜有排气管道，这个管道必须是气密性的。其气密性可以在管道的终端实现，或者如果安全柜附近有调节阀在调节阀处封闭。如果排气管道长于 3m，需增加多聚甲醛的量以补偿增加的体积。如果安全柜的排气再循环进人建筑物的排气系统，断开安全柜与建筑物系统的连接进行封闭(可以用的塑料薄膜和塑料条带)；

d、如果安全柜排气被释放进入室内，用塑料带密封排气口；

e、为了紧急排除甲醛、消毒和中和后去除中和后的甲醛，可将一软管预先放在安全柜附近，此软管须和化学通烟罩或其他合适排放有毒气体的排气装置连接；

f、将加热装置如市场上可买到的电加热煎锅，或甲醛发生器／中和器放在工作台上．温度设为 232℃～246℃，多聚甲醛被均匀喷洒在加热装置的加热表面；

g、将中和剂用的加热装置放也在工作台上。中和剂(碳酸氢氨或同等的替代品)在使用前应当与安全柜中的空气隔绝。

下面两个例子说明如何实现与空气隔绝：

示例 1：碳酸氢氨或替代品均匀喷洒在加热装置的加热表面上，用铝箔覆盖，以防止碳酸氢氨或其替代品在消毒时与甲醛反应。铝箔的放置应能使加热时氨气逸出，或者作好准备在中和阶段开始时除去铝箔。除去铝箔时不允许出现甲醛泄漏出安全柜的危险情况；

示例 2：安全柜用与手套为一整体的塑胶薄膜进行密封。碳酸氢氨或与之相当的替代物置于安全柜内的容器中封好，在中和阶段，进行消毒的人员通过手套进入安全柜而不会打破密封系统。将碳酸氢氨或与之相当的替代物从密封容器中取出，并均匀洒在加热装置的加热面上，加热装置通电，碳酸氢氨或替代品被加热释放出氨气；

h、加热板、盛水烧杯和温湿度计放在安全柜工作台上，不要在安全柜内部电源上连接电线；

i、用厚塑料膜和塑料带封闭安全柜前窗操作口。封上所有可能泄漏的区域．例如电线出口、前窗操作口周围以及塑料膜和安全柜的连接处；

j、测定安全柜内的温度和湿度；

k、温度应为 21℃以上，湿度应为 60％～85％。用加热板加热烧杯中的水达到预期的温度和湿度；

l、解聚甲醛前，应按照相关的规定以及安全措施规定严格限制进入安全柜周围的区域或房间。职业安全与卫生条例有关职业性接触甲醛的准则中要求甲醛在空气中传播浓度超过容许暴露限度的区域应规定作为控制区域，用符号和标记标示出该区域，仅限适当培训的人员进入。必须复审和遵守现行规定；

m、将加热装置的电线插入安全柜外的插座上；

n、25％的甲醛被解聚后，打开安全柜风机 10s～l5s。多聚甲醛解聚 50％、75％和 100％后重复上述步骤。万一安全柜风机不工作，用辅助风机或风扇促进安全柜内的空气循环流动，或者延长消毒时间，超过下面步骤 p 建议的时间；

o、断开多聚甲醛所用的加热板和加热装置电源；

p、使安全柜保持最少 6h，*好过夜；

q、按步骤 g 准备中和剂，将含有碳酸氢氨的加热装置和安全柜风机通电至碳酸氢氨散逸尽。同多聚甲醛的操作一样，25％碳酸氢氨分解后，打开安全柜风机 10s～l5s，万一安全柜风机不起作用，用辅助风机或电扇促进安全柜内的空气循环流动，或者中和时间延长至最少 6h；

r、安全柜保持至少 1h 后打开密封膜；

s、如果用软管排空中和的甲醛，撕开安全柜排气口的塑料覆盖物，将软管连上排气口并封上，如果软管工作正常，安全柜前窗操作口的塑料覆盖物会被吸入，安全柜前窗操作口的塑料覆盖物被割出一两个小开口(大约 15cm×15cm)，使新鲜空气进入安全柜，而中和的甲醛从安全柜排气口的软管中排出。